哈尔滨市海关技术中心主要负责黑龙江地区的出入境卫生检疫、动植物检疫和进出口食品安全、商品检验、鉴定、认证、认可和监督管理工作。全省检验检疫系统拥有6个国家重点检测实验室、2个中心实验室、4个区域实验室、20个常规实验室和24个备案实验室，基本形成了以“中心实验室为龙头，区域实验室为骨干、专业实验室为特色、常规实验室为基础、备案实验室为补充的实验室网络体系和仪器设备电子管理平台”。实验室仪器设备总值近1.6亿元，检测实验室面积超过1.2万平方米，医学实验室面积超过1500平方米，20万元以上的仪器设备达103台。可对近400种食品农产品进行物理、化学、微生物、转基因、农药、兽药残留及各种毒素的检验和鉴定，实验室检测项目累计达1800余项。