中国南方航空公司黑龙江分公司前身是成立于1992年的中国北方航空公司黑龙江分公司，曾在1997年与天鹅航空公司联合组建为北航天鹅航空有限责任公司。在航空集团新一轮的改革改组过程中，南航北方公司吸收合并了北航天鹅，恢复了其在黑龙江的分公司运营。南航黑龙江分公司于2009年正式确立了"321"发展战略，提出"构建国际、国内、省内三个网络，运营哈尔滨(哈尔滨太平国际机场)、大庆(大庆萨尔图机场)两个基地，打造哈尔滨为南航网络次枢纽"的目标，2009年大庆基地辟建，双基地模式确立。随后相继开通大庆、黑河、漠河等多个省内支线航班，增加了哈尔滨至京、穗主干线的航班密度。目前，分公司航线已达60余条，遍及国内各大城市和首尔、东京、大阪、香港和台北等多个国际城市和地区。目前南航黑龙江分公司是南航在东北地区三家执管客机数量超过20架的分公司之一，客机数量仅次于运营基地位于沈阳的南航北方分公司(27架)以及运营基地位于大连的南航大连分公司(24架)。随着分公司飞机数量也不断攀升，航线的不断增加，作为黑龙江土生土长的基地航空公司，这不但为黑龙江省"走出去，请进来"提供了更加先进的机型，更加丰富的空中航线创造了先决条件，也为黑龙江省做大做强本地民航产业提供了坚实的基础，预计到2014年底，分公司运力将增加至24架。

经济管理学院与该基地合作始于2009年，长期以来是会计学专业学生开展校外实习的重要基地，始终保持着良好的合作关系。